La prueba de Paternidad Judicial es necesaria cuando un hombre ha sido demandado en un proceso de filiación y desea demostrar que no es el padre biológico del niño, para ello el juez ordena la realización de esta, como medio de prueba. También se puede necesitar cuando se haya solicitado a un juez una suspensión de paternidad, custodia de menores, reclamos sobre derechos de herencia, etc.

En las pruebas de paternidad Judiciales, es el demandado (presunto padre) quien elije con que laboratorio se va a realizar la prueba, y le debe comunicar al juez para que el laboratorio sea notificado con la fecha y la hora de la audiencia de toma de muestra, bajo ninguna circunstancia el laboratorio es designado por el Juez.